Après des études classiques au conservatoire de Lyon, Fabien Marcos rejoint les musiciens du Collectif Mû et du Crescent jazz club. En 1996, il obtient deux 1er  prix de la Défense (meilleur orchestre et meilleure composition). Enregistre deux albums avec cet orchestre. Il se forme aux côtés de musiciens de stature internationale tels Steve Grossman, Peter King, Alain Jean-Marie, Michel Grailler, Lolo Bellonzi, Georges Arvanitas…

En 1998, il s’installe à Paris et joue régulièrement dans les clubs parisiens. Il fait partie des contrebassistes Français régulièrement appelés par les musiciens parisiens et internationaux tels que Joe Cohn, Joe Magnarelli, Alain-Jean Marie, Dmitry Baevsky, Franck Amsallem, Ralph Moore, Harold Mabern, Joe Farnsworth, Christian Escoudé, François Chassagnite, Jérôme Barde, Kirk Lightsey, Jean-loup Longnon, Marc Thomas, Florin Niculescu, China Moses et Raphaël Lemonnier… Il participe aux différents festivals de Jazz nationaux et internationaux tels que Marciac, Vienne, Tokyo, Washington, Stockholm, Amsterdam, Berlin, Moscou, Madrid, Rome, Londres, New-Delhi, Constantine, Beyrouth, Tabarka, Tanger, Dacca…

Il joue actuellement dans les formations de Fabien Mary, Mourad Benhammou, Alex Beker, William Chabbey.  Il a enregistré plusieurs albums avec ces musiciens…